More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3092 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  62.04 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  61.11 
 
 		 262 aa  339  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  49.59 
 
 		 259 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  53.78 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  51.35 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.86 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  52.86 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  49.62 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.6 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.9 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.51 
 
 		 267 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.5 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.24 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50.43 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.71 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.11 
 
 		 253 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  45.02 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.44 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.47 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.05 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.06 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.27 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.85 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.7 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  46.64 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.02 
 
 		 251 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.29 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.29 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.54 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  52.66 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  44.4 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.8 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.21 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.7 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.48 
 
 		 290 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.67 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 		 272 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.88 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.88 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.14 
 
 		 267 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  44.05 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.44 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  41.2 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.4 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  43.43 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.39 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.49 
 
 		 274 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  44.09 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.23 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.78 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  45.16 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  43.72 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.73 
 
 		 301 aa  215  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.44 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.5 
 
 		 284 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.44 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 289 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 265 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  46.34 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.93 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  42.17 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  44.12 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.21 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.8 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  43.57 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.62 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.46 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.6 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.39 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  45.85 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  42.75 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.47 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.58 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>