More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4503 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  65.16 
 
 
311 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  57.45 
 
 
275 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  52.09 
 
 
283 aa  255  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.59 
 
 
263 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  53.28 
 
 
291 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  47.45 
 
 
263 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
281 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  50.63 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.22 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.37 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.72 
 
 
262 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  50.22 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  46.48 
 
 
273 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.8 
 
 
276 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.03 
 
 
261 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.59 
 
 
304 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 
252 aa  214  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
276 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  45.63 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.44 
 
 
304 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.85 
 
 
255 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
261 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.03 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
275 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
267 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
278 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  48.18 
 
 
278 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45.88 
 
 
333 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52 
 
 
330 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
267 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.61 
 
 
254 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  47.58 
 
 
274 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.1 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  46.85 
 
 
254 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.21 
 
 
283 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.04 
 
 
259 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.25 
 
 
267 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 
260 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.22 
 
 
274 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 
254 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.86 
 
 
272 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.67 
 
 
260 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.1 
 
 
251 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.33 
 
 
276 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
250 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
261 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  46.88 
 
 
257 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50 
 
 
264 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.49 
 
 
304 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  44.4 
 
 
261 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.61 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.4 
 
 
303 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.4 
 
 
303 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.4 
 
 
303 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  43.45 
 
 
315 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  47.11 
 
 
268 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
273 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.78 
 
 
259 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  50.88 
 
 
270 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.1 
 
 
251 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.7 
 
 
307 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
251 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
268 aa  202  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.88 
 
 
259 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
308 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  47.41 
 
 
289 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  47.81 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  45.06 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.04 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  47.37 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  47.22 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  43.56 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.94 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.23 
 
 
258 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  45.8 
 
 
271 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.16 
 
 
262 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  40.8 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  47.49 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  44.67 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  43.94 
 
 
265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  45.38 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.87 
 
 
297 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.83 
 
 
272 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.88 
 
 
267 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.16 
 
 
253 aa  198  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  47.58 
 
 
284 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  41.13 
 
 
255 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  44.8 
 
 
266 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  51.74 
 
 
260 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.42 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  45.7 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.06 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  48.68 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>