More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6051 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  51.35 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  50.99 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  50.19 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  50.58 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  49.81 
 
 		 284 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.41 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  51.38 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  51.68 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  53.33 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.44 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.81 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.81 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.12 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.04 
 
 		 262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.83 
 
 		 283 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  47.43 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.41 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.08 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.78 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  45.45 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  48.07 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  45.35 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  48.58 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.03 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.07 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  53.27 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.51 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.71 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  50.47 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.02 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.18 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.43 
 
 		 282 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  49.58 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  43.98 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.92 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  48.21 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.31 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.91 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  48.21 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  48.21 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.56 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.16 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.64 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.39 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.93 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.44 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.44 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.59 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.13 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.31 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  47.32 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.48 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.24 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.53 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.05 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.44 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.4 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.21 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.05 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  51.85 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.06 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  49.09 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.21 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.89 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.84 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.78 
 
 		 291 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  39.02 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.51 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.65 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.06 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.39 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  43.6 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.78 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  45.69 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.81 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>