More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4886 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50.19 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.94 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.97 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  51.18 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  51.35 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  51.35 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  53.63 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  48.5 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  50.43 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  51.02 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.37 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  49.02 
 
 		 261 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.58 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.08 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  51.34 
 
 		 274 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.88 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.21 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.35 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  52.92 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  53.94 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.99 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.68 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.18 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.53 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  52.89 
 
 		 269 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  51.78 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.79 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  48.26 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.22 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.61 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52.74 
 
 		 272 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  53.88 
 
 		 267 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.35 
 
 		 272 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.76 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  49.6 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 		 272 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  52.46 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  53.88 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  52.46 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.19 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.21 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.59 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.58 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.18 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  48.72 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.27 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  47.86 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.58 
 
 		 251 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.15 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.96 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.6 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  52.16 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.39 
 
 		 262 aa  215  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.39 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.44 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  50.43 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.22 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.97 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.74 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.6 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.58 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.9 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  47.56 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  46.96 
 
 		 263 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.84 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  52.29 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.47 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.12 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.98 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  48.82 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>