More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0618 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  527  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  93.44 
 
 
259 aa  497  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  56.3 
 
 
254 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  54.8 
 
 
271 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  56.22 
 
 
271 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 
281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  54.58 
 
 
284 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.37 
 
 
276 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  49 
 
 
275 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  52.19 
 
 
267 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  50.57 
 
 
262 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  51.65 
 
 
269 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.42 
 
 
257 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
275 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.54 
 
 
258 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50.58 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  52.48 
 
 
278 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  53.16 
 
 
283 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  49.37 
 
 
278 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.61 
 
 
263 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.22 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50.42 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.03 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.59 
 
 
263 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.99 
 
 
272 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.09 
 
 
258 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.43 
 
 
284 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  47.68 
 
 
258 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.1 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.68 
 
 
261 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  50.21 
 
 
266 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  51.32 
 
 
281 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  47.41 
 
 
260 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  47.35 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.35 
 
 
262 aa  235  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 
259 aa  234  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 
271 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  49.58 
 
 
271 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  50.21 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  48.73 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  48.19 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.41 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.22 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.86 
 
 
261 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
264 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.12 
 
 
283 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.26 
 
 
297 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  48.95 
 
 
255 aa  232  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
254 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.12 
 
 
288 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50 
 
 
278 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.22 
 
 
263 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.47 
 
 
259 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 
272 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.85 
 
 
307 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.67 
 
 
254 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
261 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.16 
 
 
278 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  46.78 
 
 
286 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.98 
 
 
260 aa  228  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  48.31 
 
 
262 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.45 
 
 
257 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
290 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.58 
 
 
297 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.44 
 
 
291 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 
267 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
258 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.58 
 
 
306 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.46 
 
 
304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.55 
 
 
260 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.76 
 
 
276 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.66 
 
 
286 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.64 
 
 
269 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.56 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.83 
 
 
265 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.54 
 
 
285 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  46.38 
 
 
266 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.12 
 
 
246 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
297 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.77 
 
 
267 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  45.45 
 
 
298 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.56 
 
 
273 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
281 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  47.21 
 
 
280 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.42 
 
 
278 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.23 
 
 
286 aa  221  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  44.96 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 
264 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.45 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.32 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.18 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>