More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  65.16 
 
 		 267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  54.64 
 
 		 275 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  55.76 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.12 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.66 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.62 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.13 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  44.4 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.51 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  42.32 
 
 		 273 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.12 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.41 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  43.02 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.95 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.56 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  45.96 
 
 		 284 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  46.59 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 291 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.43 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.29 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  46.35 
 
 		 284 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.38 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  42.96 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  44.53 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.89 
 
 		 276 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  41.36 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.42 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  40.15 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 252 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.31 
 
 		 267 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.57 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  43.41 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.73 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  41.88 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.71 
 
 		 272 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  42.65 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  43.59 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.25 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  40.15 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.55 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.76 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.35 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  41.88 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  41.11 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 260 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  41.31 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  41.52 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  38.52 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.39 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  41.83 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  38.65 
 
 		 267 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.22 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.29 
 
 		 251 aa  185  8e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.45 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  44.48 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  39.12 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  40.07 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  38.26 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.23 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.49 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  42.96 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  41.06 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  43.14 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  42.55 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  45.1 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.09 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  43.36 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40.22 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.99 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  40.45 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  40.51 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  44.36 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.88 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  39.71 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  41.92 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  39.15 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  36.4 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  44.31 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 261 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  41.22 
 
 		 268 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  39.13 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>