More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3418 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  62.04 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  66.54 
 
 		 262 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  56.18 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  54.58 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  50.79 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  52.07 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.86 
 
 		 276 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  49.81 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.67 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.22 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.33 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  49.21 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.58 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.19 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  47.79 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.78 
 
 		 246 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.64 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  47.6 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  45.86 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.8 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.4 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  45.88 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.51 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  45.88 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.52 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.1 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.46 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.84 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.64 
 
 		 275 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.46 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.77 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.61 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.79 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  51.01 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.61 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.61 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  49.79 
 
 		 271 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.49 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  46.09 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.79 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.79 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.03 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.68 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.75 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  47.22 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.2 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  43.31 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.38 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.72 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  42.91 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.53 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  44.32 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.36 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.51 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.77 
 
 		 254 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.86 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.98 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.89 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 259 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.57 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  42.97 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.73 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.65 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.77 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.12 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.98 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 261 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 264 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.53 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.9 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  44.31 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.84 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  45.64 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>