More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0393 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  72.8 
 
 		 286 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  74.62 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  73.85 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  73.85 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  70.57 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  62.76 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 		 267 aa  308  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  57.74 
 
 		 287 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  52.99 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  52.79 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  50.85 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  52.94 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  51.32 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.88 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.92 
 
 		 254 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  48.07 
 
 		 266 aa  222  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.08 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  46.55 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  48.29 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.9 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  44.11 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  44.11 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  51.63 
 
 		 257 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.38 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  42.97 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  46.03 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.67 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  50 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.91 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.16 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.21 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  44.49 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.95 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  45.64 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.75 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.64 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  44.86 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.18 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.8 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.91 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.55 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.33 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.29 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  45.76 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.09 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  43.4 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.9 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.06 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.22 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.38 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.67 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  45.42 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.41 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  43.03 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.39 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.22 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  44.59 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.53 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.84 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.17 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45 
 
 		 255 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  44.26 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  45.23 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.62 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  41.64 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.17 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.58 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  41.2 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  45.23 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  42.29 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.48 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.27 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  45.23 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  47.69 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  42.44 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>