More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3040 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  96.9 
 
 
258 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  84.77 
 
 
263 aa  457  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  82.63 
 
 
263 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  77.61 
 
 
262 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  78.52 
 
 
272 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  77.73 
 
 
333 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  77.25 
 
 
255 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  76.86 
 
 
266 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  75.69 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  70.66 
 
 
278 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  68.46 
 
 
261 aa  387  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  67.57 
 
 
289 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  69.44 
 
 
284 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  69.05 
 
 
284 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  61.63 
 
 
278 aa  328  8e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  62.75 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  59.53 
 
 
268 aa  297  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  58.08 
 
 
274 aa  294  8e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
273 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  46.75 
 
 
254 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.68 
 
 
259 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.59 
 
 
261 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.75 
 
 
291 aa  238  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.2 
 
 
269 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.59 
 
 
330 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  44.8 
 
 
259 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.8 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  44.35 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.31 
 
 
265 aa  230  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.99 
 
 
253 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.12 
 
 
282 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  46.18 
 
 
255 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.15 
 
 
260 aa  228  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
281 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.71 
 
 
288 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.3 
 
 
266 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.78 
 
 
263 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.8 
 
 
278 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  45.71 
 
 
273 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.37 
 
 
246 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  45.71 
 
 
262 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.12 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  43.43 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  47.46 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.78 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.43 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.08 
 
 
258 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.58 
 
 
292 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.93 
 
 
276 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  48.29 
 
 
299 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
264 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  49.35 
 
 
276 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.29 
 
 
280 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.65 
 
 
311 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.44 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
267 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  46.67 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.27 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.6 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.82 
 
 
257 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.45 
 
 
297 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  47.21 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  47.19 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42 
 
 
251 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.29 
 
 
276 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.2 
 
 
261 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.08 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42.97 
 
 
264 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.08 
 
 
278 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
261 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 
275 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
276 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  47.86 
 
 
284 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.9 
 
 
284 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.21 
 
 
256 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 
278 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
250 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
251 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  41.95 
 
 
275 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.21 
 
 
274 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
264 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  42.25 
 
 
264 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.82 
 
 
251 aa  208  9e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
251 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.26 
 
 
274 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.67 
 
 
268 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.15 
 
 
260 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.44 
 
 
280 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.89 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
260 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.75 
 
 
273 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
251 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 
251 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.43 
 
 
259 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>