More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1096 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  78.95 
 
 		 280 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  79.92 
 
 		 286 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  79.62 
 
 		 274 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  74.62 
 
 		 281 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  73.18 
 
 		 284 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  64.32 
 
 		 260 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  52.51 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  53.66 
 
 		 287 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  51.74 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  50.39 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  50.39 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.5 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  47.1 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.64 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.73 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.58 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  48.09 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.03 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  46.61 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.06 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.75 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.58 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.15 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.15 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.64 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.96 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.49 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  47.41 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  45.3 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.02 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  42.69 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.17 
 
 		 275 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  44.1 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  40.53 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.21 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.02 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  45.04 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  43.53 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.82 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  42.68 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  43.16 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  42.68 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  40.8 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.1 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  46.67 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.74 
 
 		 263 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  40.53 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.03 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.98 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.04 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.74 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.19 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.37 
 
 		 263 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.84 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.93 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  42.15 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.22 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  42.91 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  43.97 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.83 
 
 		 301 aa  186  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  40.07 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  42.55 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.59 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  44.02 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  43.15 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.49 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.11 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  41.95 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.92 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.93 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  40.96 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.07 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  39.83 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.13 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  41.03 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>