More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2118 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  45.53 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  45.12 
 
 		 270 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  45.53 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  46.93 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.98 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  43.44 
 
 		 275 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  45.57 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  43.67 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  41.87 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  40.65 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  41.87 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  44.31 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  44.77 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  44.3 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.7 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  44.81 
 
 		 299 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.35 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41.04 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  42.55 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.09 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.09 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.41 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  42.26 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.62 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  42.08 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.44 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  43.32 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.27 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  42.08 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 276 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  40.24 
 
 		 282 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.62 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.09 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.88 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.27 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  41.67 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.8 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.67 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  40.93 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.11 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 281 aa  207  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.86 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.28 
 
 		 304 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  41.15 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.87 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  40.73 
 
 		 257 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  38.27 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.1 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  40.49 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 261 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  40.33 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  43.5 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.71 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.49 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.67 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.53 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  39.42 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.42 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  42.39 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  41.63 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>