More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6389 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  506  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  93.75 
 
 		 256 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  72.66 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  68.75 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51 
 
 		 262 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.18 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  51.67 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  50.41 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.42 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  50.42 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  50.41 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  48.76 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  48.79 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  48.99 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  49.17 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  50.83 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  50.83 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  50.42 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  50.63 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.38 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.42 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  48.29 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  47.45 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.97 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  49.59 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.59 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  50.2 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.5 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.77 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  49.58 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.59 
 
 		 308 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.67 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.9 
 
 		 307 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.13 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.21 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50.21 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.21 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.72 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.72 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  48.78 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  48.18 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  45.97 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.36 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 304 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.37 
 
 		 304 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  48.37 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.9 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  45.93 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.77 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.86 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.15 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.02 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.14 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.71 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.93 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.91 
 
 		 280 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  44.9 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  46.69 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.93 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.02 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.53 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.44 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  49.17 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  44.21 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.53 
 
 		 292 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.57 
 
 		 297 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 		 438 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.03 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.18 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.92 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.18 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.86 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  45.31 
 
 		 434 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.38 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.58 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.03 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  45.81 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.82 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>