More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  100 
 
 
269 aa  533  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  71.37 
 
 
271 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  66.29 
 
 
279 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  65.92 
 
 
279 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  68.53 
 
 
287 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  68.27 
 
 
287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  62.04 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
266 aa  310  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  61.85 
 
 
269 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  60 
 
 
267 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  58.57 
 
 
262 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  56.97 
 
 
265 aa  291  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  54.2 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  55.21 
 
 
285 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
255 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  54.75 
 
 
288 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  54.37 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  54.55 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.09 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  55.7 
 
 
252 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 
284 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  55.06 
 
 
281 aa  268  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  53.14 
 
 
247 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  54.36 
 
 
291 aa  261  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.41 
 
 
281 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  50.74 
 
 
281 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  50.37 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  50.37 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  48.97 
 
 
259 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  49.4 
 
 
262 aa  244  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  50.42 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 
251 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50.81 
 
 
260 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  47.74 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  51.2 
 
 
278 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  53.54 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  50.2 
 
 
276 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.42 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.15 
 
 
258 aa  237  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
261 aa  236  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.25 
 
 
251 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  50.61 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.59 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
251 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
255 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.46 
 
 
251 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  51.6 
 
 
261 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.68 
 
 
267 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.53 
 
 
259 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.99 
 
 
272 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
278 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.53 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
264 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
261 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  49.6 
 
 
263 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.07 
 
 
257 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.89 
 
 
253 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.52 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.35 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  46.19 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50 
 
 
288 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.56 
 
 
256 aa  221  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.21 
 
 
260 aa  221  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.66 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.8 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.08 
 
 
280 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.83 
 
 
263 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  50.21 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.7 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.35 
 
 
267 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.7 
 
 
304 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 
252 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.41 
 
 
246 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.31 
 
 
259 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.82 
 
 
254 aa  218  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
264 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.69 
 
 
262 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 
259 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.27 
 
 
293 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.21 
 
 
256 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.31 
 
 
260 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.25 
 
 
259 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.48 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.65 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.65 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>