More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0580 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  65.71 
 
 		 286 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  63.64 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  64.23 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.65 
 
 		 281 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  63.41 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  61.38 
 
 		 259 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  61.51 
 
 		 281 aa  317  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  61.89 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  61.89 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.38 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  61.07 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  64.78 
 
 		 291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  60.08 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  60.91 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  60.49 
 
 		 286 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  57.14 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  57.72 
 
 		 259 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  54.86 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  56.97 
 
 		 269 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  55.92 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  57.2 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  57.26 
 
 		 276 aa  285  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  56.79 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 266 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  54.69 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  56.71 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  54.69 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  57.14 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  55.6 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  51.57 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  49.6 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  50 
 
 		 267 aa  254  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.39 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  252  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  51.97 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.15 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  51.42 
 
 		 263 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  49.18 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  51.09 
 
 		 247 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.19 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.38 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  47.54 
 
 		 256 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.59 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  49.18 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.37 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.37 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.96 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.93 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.06 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.85 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.9 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.77 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.58 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.16 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  47.77 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.12 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.9 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.12 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.66 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.09 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.64 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.68 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  47.11 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  47.11 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  51.77 
 
 		 284 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.64 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.9 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.82 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.5 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  48.35 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  50.44 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  44.71 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.5 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.25 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>