More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1352 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  78.24 
 
 
266 aa  410  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  78.29 
 
 
267 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  78.66 
 
 
269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  61.81 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  62.1 
 
 
287 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  59.76 
 
 
269 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  62.3 
 
 
287 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  58.57 
 
 
269 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
279 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  58.63 
 
 
279 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  58.97 
 
 
247 aa  288  7e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  59.83 
 
 
252 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
255 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  55.6 
 
 
265 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  55.1 
 
 
286 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
284 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  51.18 
 
 
261 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  52.8 
 
 
288 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  53.33 
 
 
281 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  54.1 
 
 
285 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  52 
 
 
298 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  53.33 
 
 
281 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  53.33 
 
 
281 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.22 
 
 
281 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  53.41 
 
 
281 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  51 
 
 
256 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.6 
 
 
281 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  51.82 
 
 
291 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
261 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  51.84 
 
 
256 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  56.74 
 
 
276 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.9 
 
 
267 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  49.17 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  51.43 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  55.76 
 
 
245 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.34 
 
 
254 aa  239  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.08 
 
 
254 aa  238  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  54.26 
 
 
278 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.67 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  53.98 
 
 
263 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.83 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.53 
 
 
254 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  50.64 
 
 
304 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.58 
 
 
256 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  50.81 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.97 
 
 
307 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  48.99 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
267 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.23 
 
 
262 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 
286 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  52.21 
 
 
265 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  51.77 
 
 
266 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  48.37 
 
 
260 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
251 aa  228  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  47.39 
 
 
276 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
267 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.47 
 
 
272 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 
253 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.03 
 
 
274 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.03 
 
 
289 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  51.33 
 
 
266 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.89 
 
 
261 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  45.92 
 
 
255 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  51.05 
 
 
262 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.1 
 
 
254 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.09 
 
 
258 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
260 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  51.77 
 
 
271 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.88 
 
 
275 aa  224  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.88 
 
 
303 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.49 
 
 
303 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.6 
 
 
274 aa  223  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.15 
 
 
287 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.23 
 
 
257 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.56 
 
 
304 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.56 
 
 
304 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.49 
 
 
303 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
255 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.06 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.86 
 
 
246 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  51.79 
 
 
261 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.58 
 
 
303 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.68 
 
 
258 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  51.33 
 
 
273 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
262 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
251 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  49.56 
 
 
268 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  51.33 
 
 
273 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  51.33 
 
 
273 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.28 
 
 
263 aa  221  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.83 
 
 
306 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.54 
 
 
267 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.02 
 
 
263 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  41.84 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  49.57 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>