More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3265 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  93.41 
 
 
266 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  97.8 
 
 
273 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  93.04 
 
 
266 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  97.8 
 
 
273 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  92.73 
 
 
275 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  94.82 
 
 
271 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  80.4 
 
 
262 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  75 
 
 
265 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  72 
 
 
263 aa  359  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  71.81 
 
 
265 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  71.81 
 
 
265 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  65.82 
 
 
264 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  69.6 
 
 
263 aa  341  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  73.58 
 
 
278 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  70.93 
 
 
268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  67.05 
 
 
262 aa  332  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  68.36 
 
 
276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  65.08 
 
 
280 aa  326  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  66.16 
 
 
276 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  64.4 
 
 
263 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  65.74 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  61.36 
 
 
270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  66.92 
 
 
265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  66.42 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  66.27 
 
 
266 aa  291  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  65.88 
 
 
266 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  61.81 
 
 
258 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  47.33 
 
 
262 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.78 
 
 
284 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
267 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.87 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  232  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.2 
 
 
286 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
253 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.35 
 
 
278 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.91 
 
 
255 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.33 
 
 
262 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.59 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  46.31 
 
 
265 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 
259 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.12 
 
 
259 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.15 
 
 
267 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  47.72 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.99 
 
 
271 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.68 
 
 
263 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  48.95 
 
 
269 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50 
 
 
298 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.77 
 
 
258 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.56 
 
 
289 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  44.3 
 
 
265 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  46.42 
 
 
267 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 
252 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  47.92 
 
 
266 aa  215  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
254 aa  215  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.41 
 
 
261 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.8 
 
 
256 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.28 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  44 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  51.8 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.2 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.12 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  50.42 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.52 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.67 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.37 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.37 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.95 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  46.15 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.7 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.2 
 
 
255 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.45 
 
 
271 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.35 
 
 
281 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
267 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  44.83 
 
 
287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
279 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  44.83 
 
 
287 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.89 
 
 
306 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.67 
 
 
263 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.47 
 
 
259 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  43.27 
 
 
259 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.99 
 
 
287 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.61 
 
 
259 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.67 
 
 
260 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  42.86 
 
 
247 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 
271 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.8 
 
 
267 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.98 
 
 
260 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
256 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.4 
 
 
272 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.93 
 
 
264 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
279 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  48.39 
 
 
259 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.95 
 
 
281 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.37 
 
 
259 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.03 
 
 
253 aa  208  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>