More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0859 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  510  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  64.78 
 
 
262 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  62.06 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.77 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  61.11 
 
 
262 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  62.15 
 
 
276 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  60.87 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  62.1 
 
 
263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  62.75 
 
 
271 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  61.07 
 
 
270 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  61.3 
 
 
266 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  60.92 
 
 
266 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.35 
 
 
275 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  62.35 
 
 
273 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  62.35 
 
 
273 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  62.35 
 
 
273 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  60.31 
 
 
265 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  60.31 
 
 
265 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  61.16 
 
 
268 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  56.15 
 
 
280 aa  291  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  59.11 
 
 
265 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  63.45 
 
 
265 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  61.89 
 
 
266 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  55.98 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  61.51 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  62.55 
 
 
263 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  58.66 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  61.22 
 
 
278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.81 
 
 
261 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.7 
 
 
251 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.78 
 
 
284 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  46.77 
 
 
260 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  46.5 
 
 
259 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.46 
 
 
286 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
255 aa  224  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
267 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  50.63 
 
 
262 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.26 
 
 
262 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  48.16 
 
 
269 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 
261 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.8 
 
 
285 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  50.91 
 
 
267 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.9 
 
 
265 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  42.68 
 
 
255 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  50.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  47.06 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.45 
 
 
263 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  49.59 
 
 
259 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.02 
 
 
258 aa  218  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
267 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.09 
 
 
258 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50 
 
 
298 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  45.27 
 
 
250 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  51.32 
 
 
311 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  49.37 
 
 
267 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.7 
 
 
259 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
256 aa  215  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.26 
 
 
306 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  46.33 
 
 
265 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.54 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.35 
 
 
659 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  45.45 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.57 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.18 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  47.74 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.68 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  51.39 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  50.64 
 
 
288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.92 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.7 
 
 
272 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 
279 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.61 
 
 
304 aa  211  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.89 
 
 
259 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  44.9 
 
 
276 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.31 
 
 
287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.37 
 
 
282 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.95 
 
 
281 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.2 
 
 
283 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.4 
 
 
261 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 
311 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.68 
 
 
260 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.87 
 
 
271 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
278 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.86 
 
 
264 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.67 
 
 
262 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
276 aa  208  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.22 
 
 
259 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.74 
 
 
257 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.35 
 
 
281 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.35 
 
 
281 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
261 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.9 
 
 
272 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  47.08 
 
 
269 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>