More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0550 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  57.77 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  57.26 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.12 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  59.91 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  55.42 
 
 		 288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  54.2 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 284 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  56.61 
 
 		 298 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  60 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  53.05 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  53.05 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  58.5 
 
 		 261 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  58.82 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 255 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  52.67 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.1 
 
 		 281 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  57.27 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  55.1 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  52.82 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  54.77 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  57.67 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  57.75 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  52.57 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  52.57 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  52.23 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  56.74 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  50.97 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  53.53 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  53.53 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  52.79 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  50.2 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.02 
 
 		 663 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.94 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.89 
 
 		 669 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  52.14 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.81 
 
 		 669 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  50 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.81 
 
 		 669 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  51.09 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 		 668 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  50.22 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.24 
 
 		 673 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.41 
 
 		 657 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.09 
 
 		 668 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.25 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.77 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.39 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.04 
 
 		 668 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.04 
 
 		 668 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.74 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.34 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.25 
 
 		 254 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.09 
 
 		 667 aa  225  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  46.88 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.8 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.34 
 
 		 263 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  48.29 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  52 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 251 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48 
 
 		 659 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.96 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.35 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.35 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.42 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.14 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.88 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.79 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.24 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.68 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.53 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.09 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.96 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.03 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.93 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.75 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.89 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44.31 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  41.73 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  48.02 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  41.73 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  48.25 
 
 		 245 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.38 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  47.11 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 251 aa  215  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 253 aa  215  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.36 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  49.58 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>