More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2673 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  74 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  71.37 
 
 		 264 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  69.53 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  68.92 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  67.94 
 
 		 262 aa  341  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  67.42 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  65.4 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  67.58 
 
 		 276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  66.67 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  68.53 
 
 		 276 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  65.15 
 
 		 264 aa  331  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  68 
 
 		 271 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  67.6 
 
 		 266 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  67.2 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  68 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  67.6 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  67.6 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  67.6 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  62.6 
 
 		 263 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  63.02 
 
 		 265 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  63.02 
 
 		 265 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  67.07 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  67.35 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  65.75 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  65.89 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  64.96 
 
 		 266 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  61.11 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.59 
 
 		 262 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.39 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.19 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.09 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.95 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  50 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  49.22 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  49.59 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.6 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  48.83 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.88 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.05 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.7 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.92 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.1 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.9 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.15 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.95 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.93 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.66 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.1 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.18 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.65 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.15 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.53 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.65 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  49.4 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.94 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 434 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 		 438 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.44 
 
 		 271 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.46 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.23 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  44.86 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.1 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.44 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.9 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  51.11 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  52.14 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.54 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  44.49 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  48.54 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.77 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  49.78 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  47.39 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.37 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  45.95 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.79 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.5 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.11 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.5 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  46.09 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  48.29 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  47.28 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  47.18 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.93 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>