More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3611 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.93 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.15 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.94 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.86 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.45 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.62 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.54 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.7 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.41 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.19 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.75 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.12 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.12 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  47.58 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.93 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.8 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.8 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.8 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.43 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.95 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.13 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.12 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.52 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.25 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.15 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.06 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  43.65 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  47.11 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.47 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.96 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 289 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.55 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.36 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  43.35 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.7 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.83 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.41 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.53 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  47.95 
 
 		 447 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.22 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.83 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.52 
 
 		 304 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.73 
 
 		 292 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.73 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.46 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.7 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.06 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  47.62 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.19 
 
 		 446 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.95 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  44.94 
 
 		 448 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.13 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  45.61 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  47.39 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.95 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.73 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.75 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.64 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.4 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  42.64 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  42.64 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.61 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  45.92 
 
 		 441 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  46.34 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  43.22 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.2 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  53.61 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  44.35 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.4 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.02 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.4 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.4 
 
 		 303 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.58 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  45.61 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  43.62 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  46.48 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  41.98 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  48.72 
 
 		 433 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  47.79 
 
 		 263 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  40.08 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.85 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  44.78 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  44.27 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>