More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4036 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  61.11 
 
 		 261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  57.95 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  57.58 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  58.02 
 
 		 270 aa  321  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.02 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  57.85 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  55.85 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  58.91 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  56.88 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  54.37 
 
 		 269 aa  308  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  57.63 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  58.53 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  56.81 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 		 270 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  56.81 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  55.68 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  56.81 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  59.09 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  52.63 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  55.04 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  57.32 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  51.47 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  54.17 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  53.85 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  53.85 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  53.08 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  50.74 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.55 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.16 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.16 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  53.52 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.74 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  50.77 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  50.38 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  50.78 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  50.78 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  51.55 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.17 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  50.96 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  48.84 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.3 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.11 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  45.49 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.22 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.95 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.06 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.21 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.34 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  42.64 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.54 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.93 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.83 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.2 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.9 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.38 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  41.15 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  40.8 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.86 
 
 		 436 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.46 
 
 		 254 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.58 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.08 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  40.44 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.8 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  41.09 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.4 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.12 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  44.03 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  44.1 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.77 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  40.86 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.37 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 		 279 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  41.63 
 
 		 439 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  43.67 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  42.86 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.89 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.33 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>