More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3912 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  52.63 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.65 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.83 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  45.49 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  45.49 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  48.05 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.26 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.35 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  41.96 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.03 
 
 		 258 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  41.96 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.56 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  42.91 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  46.19 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  42.58 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  40.86 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.63 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.45 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.57 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  41.38 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.83 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  41.57 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  41.38 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  42.25 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  43.6 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  42.53 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  42.29 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.08 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  41.18 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  40.67 
 
 		 288 aa  214  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  44.92 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  41.73 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.23 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.45 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.85 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.66 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  42.28 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.12 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  41.02 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.44 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.29 
 
 		 289 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  40.68 
 
 		 265 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.99 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  40.46 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.3 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.85 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  44.53 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  40.24 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  41.67 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  42.08 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 264 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  40.23 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  39.54 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.89 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  39.54 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  39.54 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  39.54 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 265 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.68 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  46.08 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.31 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  41.39 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.37 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  46.08 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.37 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.66 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.78 
 
 		 282 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  41.34 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.03 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.23 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.37 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.17 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.24 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2790  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  42.69 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>