More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3211 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  72.52 
 
 
268 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  72.03 
 
 
286 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  72.08 
 
 
272 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  73.58 
 
 
270 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  69.85 
 
 
281 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  70.23 
 
 
281 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  69.29 
 
 
281 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  67.94 
 
 
292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  67.94 
 
 
292 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  66.28 
 
 
269 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  59.16 
 
 
270 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.16 
 
 
270 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  57.25 
 
 
270 aa  318  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
270 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  56.11 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  56.23 
 
 
270 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  56.23 
 
 
270 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  56.98 
 
 
274 aa  311  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  56.88 
 
 
273 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  55.35 
 
 
281 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  56.88 
 
 
273 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  55.73 
 
 
282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  55.13 
 
 
269 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  57.14 
 
 
285 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  59.06 
 
 
261 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  48.89 
 
 
285 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  49.06 
 
 
272 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  48.68 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  49.24 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  48.85 
 
 
265 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  48.3 
 
 
272 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  49.62 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  49.61 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  49.62 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
265 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  48.84 
 
 
265 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  48.84 
 
 
265 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  47.74 
 
 
279 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.44 
 
 
272 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
265 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  49.61 
 
 
264 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  49.19 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.61 
 
 
264 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.74 
 
 
269 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.53 
 
 
288 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.03 
 
 
258 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.49 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
278 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.59 
 
 
283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  45.17 
 
 
275 aa  222  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  45.42 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.97 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  49.4 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  46.75 
 
 
280 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.88 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.86 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.44 
 
 
286 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  45.17 
 
 
264 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.53 
 
 
275 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  42.53 
 
 
276 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  49.15 
 
 
262 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
260 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.58 
 
 
267 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  49.15 
 
 
262 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  49.15 
 
 
262 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.17 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.59 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  45.73 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.96 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.96 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.1 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  46.96 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  46.96 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.8 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.37 
 
 
255 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.31 
 
 
267 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.16 
 
 
283 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.45 
 
 
271 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
260 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 
271 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  46.56 
 
 
252 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.85 
 
 
267 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  47.11 
 
 
267 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.23 
 
 
271 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 
261 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
264 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.58 
 
 
279 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  45.6 
 
 
271 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>