More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3115 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  79.55 
 
 		 272 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  78.79 
 
 		 272 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  77.69 
 
 		 285 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  74.62 
 
 		 272 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  74.81 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  72.76 
 
 		 265 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  71.98 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  72.37 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  71.6 
 
 		 265 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  72.37 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  72.37 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  72.76 
 
 		 265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  73.26 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  73.26 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  73.15 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  71.21 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  65.25 
 
 		 264 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  56.37 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  55.68 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  55.13 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  54.75 
 
 		 270 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  54.75 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  53.21 
 
 		 269 aa  294  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.58 
 
 		 270 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  55.04 
 
 		 270 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  54.17 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  54.17 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  51.85 
 
 		 275 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  51.43 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  55.28 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  53.44 
 
 		 274 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  49.23 
 
 		 286 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  51.31 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  51.95 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  51.56 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  51.56 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  49.81 
 
 		 268 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  51.16 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  51.16 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  50.78 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  49.06 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  49.42 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.43 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  49.01 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.99 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.71 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.11 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.3 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.49 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.47 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.87 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.62 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.44 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.67 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.42 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  43.02 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.2 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.25 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.02 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.92 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.07 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  41.51 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.37 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.44 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.74 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  44 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 264 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.16 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  39.76 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  43.19 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  45.78 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  45.35 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.13 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  40.55 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  42.8 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.25 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.73 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  42.68 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>