More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1831 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  98.52 
 
 
270 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  91.79 
 
 
274 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  83.64 
 
 
282 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  82.9 
 
 
270 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  81.51 
 
 
275 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  79.01 
 
 
269 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  76.53 
 
 
281 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  78.81 
 
 
270 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  79.32 
 
 
270 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  79.32 
 
 
270 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  65.65 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  61.18 
 
 
261 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  60.69 
 
 
286 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  60.9 
 
 
272 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  59.16 
 
 
282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  60.69 
 
 
292 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  60.31 
 
 
292 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  58.02 
 
 
273 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  58.02 
 
 
273 aa  321  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  60.23 
 
 
268 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  57.47 
 
 
281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  57.09 
 
 
281 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  58.78 
 
 
269 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  59.47 
 
 
270 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  56.7 
 
 
281 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
265 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
265 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
265 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
265 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
288 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
288 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  55.81 
 
 
288 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  55.43 
 
 
265 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  55.04 
 
 
272 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  53.88 
 
 
265 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  55.04 
 
 
265 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  53.26 
 
 
265 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  55.04 
 
 
264 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.26 
 
 
265 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  53.26 
 
 
265 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.87 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.65 
 
 
264 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  53.23 
 
 
272 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.02 
 
 
272 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.87 
 
 
265 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.87 
 
 
265 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  53.99 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  52.85 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  53.41 
 
 
279 aa  281  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  52.08 
 
 
267 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  55.7 
 
 
264 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.85 
 
 
288 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.47 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
275 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.83 
 
 
269 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.59 
 
 
278 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  50 
 
 
267 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.59 
 
 
258 aa  224  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  42.22 
 
 
273 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  41.96 
 
 
276 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.93 
 
 
255 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.69 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  46.83 
 
 
263 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.31 
 
 
252 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.93 
 
 
297 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  46.32 
 
 
280 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
264 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.98 
 
 
273 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.24 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.3 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 
278 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  46.32 
 
 
271 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.72 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.76 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  45.16 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.99 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.48 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.53 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.53 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.08 
 
 
254 aa  211  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.31 
 
 
263 aa  211  9e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.83 
 
 
279 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.96 
 
 
304 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.04 
 
 
291 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  45.08 
 
 
268 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.41 
 
 
259 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
281 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.99 
 
 
285 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
254 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  45.83 
 
 
269 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
264 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.5 
 
 
432 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  43.48 
 
 
262 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
267 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.25 
 
 
279 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.04 
 
 
266 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  42.41 
 
 
270 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.03 
 
 
252 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>