More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2273 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  567  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  81.23 
 
 		 281 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  81.51 
 
 		 270 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  81.51 
 
 		 270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  79.85 
 
 		 282 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  79.32 
 
 		 270 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  78.57 
 
 		 270 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  80.6 
 
 		 274 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  78.2 
 
 		 270 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  77.82 
 
 		 269 aa  434  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  77.44 
 
 		 270 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  64.59 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  59.16 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  64.58 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  58.4 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  58.08 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  56.11 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  54.55 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  57.25 
 
 		 292 aa  308  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  57.09 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  54.17 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  56.87 
 
 		 270 aa  304  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  53.82 
 
 		 281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  52.63 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  52.63 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  57.02 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  51.85 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  53.88 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.21 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  53.49 
 
 		 265 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  53.49 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.9 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  51.91 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.9 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.9 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.33 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  53.88 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  52.45 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.26 
 
 		 264 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  52.08 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  52.65 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  51.14 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  50.38 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.57 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  48.68 
 
 		 264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.91 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  48.81 
 
 		 263 aa  234  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.59 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.18 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.7 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  43.7 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.18 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.14 
 
 		 297 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.29 
 
 		 252 aa  225  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 261 aa  224  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  46.12 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  40.86 
 
 		 276 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.27 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.53 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.91 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.15 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.14 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  45.2 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  41.98 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.54 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.96 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.68 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.53 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  41.67 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.91 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.64 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.07 
 
 		 436 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.92 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.21 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  44.9 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.18 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.76 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.98 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 254 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>