More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1199 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  91.48 
 
 		 270 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  91.11 
 
 		 270 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  82.22 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  81.11 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  78.81 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  79.18 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  76.12 
 
 		 269 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  77.44 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  78.57 
 
 		 274 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  73.57 
 
 		 281 aa  417  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  65.78 
 
 		 285 aa  353  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  57.2 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  57.2 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  60.08 
 
 		 272 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  59.77 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  58.24 
 
 		 282 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  62.92 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  58.24 
 
 		 286 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  59.7 
 
 		 292 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  63.37 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  55.68 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  54.79 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  54.41 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  53.93 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  54.02 
 
 		 281 aa  294  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  53.56 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  53.41 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  54.62 
 
 		 285 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.61 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  54.41 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  54.26 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  53.64 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  54.41 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  54.2 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.02 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  54.2 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  54.2 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  54.44 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.62 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  54.62 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  52.43 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  52.45 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.42 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.78 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  46.01 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.35 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.39 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.36 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  42.58 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.09 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.68 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  50.44 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.44 
 
 		 280 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.96 
 
 		 254 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.27 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.2 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  45.34 
 
 		 436 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.73 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  40.98 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.7 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.73 
 
 		 254 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.34 
 
 		 436 aa  214  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 259 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.1 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.84 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  44.19 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.83 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.71 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.91 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.81 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.53 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.9 
 
 		 432 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  48.66 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.38 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.1 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.24 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.53 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  44.96 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  43.53 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.89 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>