More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2257 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  67.05 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  66.67 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  65.78 
 
 		 270 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  66.16 
 
 		 270 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  65.91 
 
 		 270 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  64.42 
 
 		 270 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  64.04 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  63 
 
 		 281 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  66.16 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  63.57 
 
 		 269 aa  349  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  63.5 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  62.69 
 
 		 261 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 		 270 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  57.52 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  60.08 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  61.63 
 
 		 272 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  55.56 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  57.41 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  57.03 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  57.41 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  59.09 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  59.09 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  57.52 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  57.52 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  55.43 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  55.51 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.12 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  55.1 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  55.1 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.73 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.73 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.73 
 
 		 265 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  52.34 
 
 		 265 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  52.34 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  51.95 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.67 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  52.34 
 
 		 265 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  52.42 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  51.53 
 
 		 285 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  52.34 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.95 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  50.38 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  52.46 
 
 		 264 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  45.55 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.07 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.09 
 
 		 258 aa  225  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.91 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.89 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  43.82 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.53 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.34 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  43.56 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.7 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.56 
 
 		 275 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.23 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  42.59 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  41.47 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  43.44 
 
 		 436 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.85 
 
 		 436 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.26 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.73 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.56 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.8 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.54 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.5 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.76 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.25 
 
 		 252 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.52 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.27 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.3 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  43.91 
 
 		 284 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.42 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.15 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.19 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  42.45 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  42 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.88 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  47.89 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>