More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2106 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  91.29 
 
 		 268 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  85.44 
 
 		 286 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  78.73 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  72.08 
 
 		 282 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  68.97 
 
 		 281 aa  374  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  68.97 
 
 		 281 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  69.47 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  67.56 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  68.44 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  66.03 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  62.55 
 
 		 261 aa  329  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  59.16 
 
 		 275 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  60.9 
 
 		 270 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.9 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  58.21 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  59.62 
 
 		 282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 270 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  59.39 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  59.39 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  57.93 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  57.03 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  60.54 
 
 		 274 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  61.63 
 
 		 285 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  55.04 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  55.04 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  53.52 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  51.31 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.51 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  51.74 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  51.74 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  51.33 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.51 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  51.74 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  51.33 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.81 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.12 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.12 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  49.24 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  51.16 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  51.95 
 
 		 265 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  48.11 
 
 		 267 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  51.16 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.78 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.8 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.8 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  47.13 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.4 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.44 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.23 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.45 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.53 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.27 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.66 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.58 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.56 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.27 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.37 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.73 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 290 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.54 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.49 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.92 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.3 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  45.63 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.16 
 
 		 283 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.75 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.12 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.45 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  42.68 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.89 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  42.69 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.05 
 
 		 292 aa  205  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.21 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.25 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.84 
 
 		 253 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  44.44 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  48.93 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  45.89 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  43.13 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.03 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>