More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2253 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  88.21 
 
 
268 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  85.44 
 
 
272 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  78.2 
 
 
270 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  72.03 
 
 
282 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  67.79 
 
 
281 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  68.97 
 
 
281 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  67.17 
 
 
281 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  64.46 
 
 
292 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  69.11 
 
 
269 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  63.76 
 
 
292 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  59.39 
 
 
270 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  60.69 
 
 
270 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.31 
 
 
270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  59 
 
 
282 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  58.4 
 
 
275 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  66.11 
 
 
261 aa  322  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  59.92 
 
 
274 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  57.79 
 
 
270 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  57.79 
 
 
270 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 
270 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  55.94 
 
 
269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  60.08 
 
 
285 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  56.81 
 
 
273 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  56.81 
 
 
273 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  53.11 
 
 
281 aa  301  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  52.96 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
265 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
288 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
288 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
265 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
265 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
288 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 
265 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  52.55 
 
 
265 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  52.16 
 
 
265 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  52.16 
 
 
265 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  51.75 
 
 
272 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  51.75 
 
 
272 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  51.38 
 
 
265 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  50.99 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  49.23 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  50.99 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  51.18 
 
 
279 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.62 
 
 
272 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  51.38 
 
 
265 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  50.98 
 
 
285 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  50.78 
 
 
264 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.39 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  48.11 
 
 
267 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  46.92 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
275 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.53 
 
 
288 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  49.39 
 
 
252 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  49.39 
 
 
252 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  49.39 
 
 
252 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.69 
 
 
258 aa  227  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.53 
 
 
286 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.38 
 
 
280 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.76 
 
 
251 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.74 
 
 
279 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.27 
 
 
286 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.32 
 
 
291 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.12 
 
 
269 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.67 
 
 
297 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.41 
 
 
261 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.41 
 
 
283 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  43.53 
 
 
267 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.61 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.75 
 
 
260 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.78 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.57 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.39 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.15 
 
 
254 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.31 
 
 
283 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
254 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  46.75 
 
 
271 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.46 
 
 
436 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  42.44 
 
 
255 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
253 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
264 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  41.51 
 
 
436 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  41.6 
 
 
275 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.21 
 
 
252 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
267 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.8 
 
 
263 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.06 
 
 
273 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 
278 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 
271 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  42.8 
 
 
271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  52.63 
 
 
262 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
261 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  44.92 
 
 
439 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.06 
 
 
272 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  41.18 
 
 
276 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
278 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>