More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2776 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  74.81 
 
 		 262 aa  415  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  46.59 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  44.35 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  45.15 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  44.53 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  42.91 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  44.27 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 229 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  41.41 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  47.49 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  44.86 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  41.98 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.83 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  42.02 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.17 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.22 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.52 
 
 		 280 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  50 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  41.8 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  50.97 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  49.46 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.85 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  50.52 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  48.08 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  45.11 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  40.73 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  42.19 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.4 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  47.69 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  42.13 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.3 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.79 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.44 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  49.48 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  40 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  41.41 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  47.66 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  41.09 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.24 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  41.09 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 288 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 288 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 288 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  40 
 
 		 272 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.53 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.09 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  45.15 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  41 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.87 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  41.41 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  41.41 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  47.12 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  41.94 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.99 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  45.33 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  45.74 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.8 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  41.02 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.13 
 
 		 292 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.53 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>