More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0880 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  526  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  68.75 
 
 
255 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  65.23 
 
 
255 aa  350  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  62.85 
 
 
248 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  54.8 
 
 
251 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  56.45 
 
 
260 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  51.38 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  45.1 
 
 
257 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
263 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
254 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
254 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
229 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  43.87 
 
 
254 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 
254 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
254 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
254 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  43.48 
 
 
254 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
254 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  39.61 
 
 
285 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  43.65 
 
 
262 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  41.41 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.32 
 
 
258 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  38.37 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  38.37 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  41.18 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.13 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
264 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
278 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.71 
 
 
254 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  41.73 
 
 
275 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  38.78 
 
 
280 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  42.8 
 
 
284 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.71 
 
 
254 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.4 
 
 
267 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.7 
 
 
297 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.27 
 
 
286 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.32 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  38.15 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.32 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  38.96 
 
 
274 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.05 
 
 
256 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  37.35 
 
 
272 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  38.4 
 
 
284 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
259 aa  188  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
261 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  37.75 
 
 
272 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  38.56 
 
 
273 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  36.76 
 
 
285 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.58 
 
 
261 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  39.44 
 
 
297 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  38.91 
 
 
291 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  41.35 
 
 
271 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  40.93 
 
 
271 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  38.65 
 
 
267 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
288 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
288 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
288 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  40.59 
 
 
307 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
271 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.5 
 
 
279 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  37.75 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.75 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  36.03 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.73 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  35.43 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  41.59 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.12 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  37.45 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  39.68 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  37.45 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  37.4 
 
 
282 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.44 
 
 
293 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.44 
 
 
293 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  39.09 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  40 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  40.26 
 
 
275 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  40.43 
 
 
269 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  36.76 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  43.48 
 
 
287 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  36.08 
 
 
267 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  37.94 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  36.14 
 
 
279 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  37.05 
 
 
252 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  37.94 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
256 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  40.91 
 
 
272 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
253 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  37.12 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>