More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1835 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  64.63 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  58.63 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  55.82 
 
 		 255 aa  292  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  54.8 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  50.98 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  50.41 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  45.88 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  44.53 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  48.26 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  41.94 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 254 aa  214  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  41.94 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  41.94 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  45.38 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 263 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  39.92 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  40.32 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.13 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  40.73 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  39.37 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  39.92 
 
 		 285 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  37.75 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  37.9 
 
 		 272 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  40.96 
 
 		 285 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  40.6 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  43.1 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  40.23 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.67 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  39.37 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  40.64 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  36.12 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  40.96 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  40.34 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.19 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  40.71 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.91 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  39.84 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  39.85 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  39.06 
 
 		 280 aa  181  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  35.69 
 
 		 271 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 281 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  35.97 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  43.4 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  39.45 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.79 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.06 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.32 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.36 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  41.33 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  39.21 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  41.05 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.78 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.36 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  42.65 
 
 		 261 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  38.4 
 
 		 288 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  41.52 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  37.75 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.34 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  37.94 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  39.84 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 272 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  38.98 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>