More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6299 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  39.61 
 
 
256 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  41.6 
 
 
248 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  40.48 
 
 
255 aa  215  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  44.03 
 
 
262 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  44.86 
 
 
262 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  43.68 
 
 
260 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  43.48 
 
 
269 aa  202  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  43.36 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  42.52 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.78 
 
 
254 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  42.02 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.02 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  39.02 
 
 
281 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
265 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
265 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
265 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
265 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  39.84 
 
 
281 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
263 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  39.77 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
270 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  44.4 
 
 
275 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
254 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
254 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
254 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
254 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
270 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  40.32 
 
 
285 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  41.74 
 
 
282 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  41.15 
 
 
270 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  40.96 
 
 
251 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  41.15 
 
 
270 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  38.06 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  40.73 
 
 
281 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  41.43 
 
 
292 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  38.17 
 
 
267 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
267 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  38.82 
 
 
265 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.82 
 
 
272 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  42.56 
 
 
281 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  40.15 
 
 
272 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  38.82 
 
 
265 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  38.82 
 
 
265 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  38.52 
 
 
265 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  46.93 
 
 
255 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  38.82 
 
 
265 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  39.53 
 
 
254 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
265 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  41.73 
 
 
260 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  38.82 
 
 
265 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  41.99 
 
 
270 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  42.79 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  40 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.99 
 
 
270 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  38.1 
 
 
279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  41.85 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  40.16 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  42.08 
 
 
261 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  38.93 
 
 
273 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  36.86 
 
 
258 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.89 
 
 
254 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  36.82 
 
 
254 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  41.23 
 
 
263 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  39.06 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  41.9 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  36.82 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  34.04 
 
 
284 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  42.15 
 
 
260 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  39.61 
 
 
270 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  39.44 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.04 
 
 
259 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  37.36 
 
 
265 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  38.24 
 
 
273 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  38.24 
 
 
273 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  43.67 
 
 
255 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
261 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  35.64 
 
 
282 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
249 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  41.35 
 
 
263 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  42.92 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  36.51 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  35.66 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  44.29 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  35.95 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>