More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2295 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  46.49 
 
 
275 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  57.6 
 
 
223 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
249 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
249 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
244 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
265 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  45.71 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  49.56 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  49.55 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  44.1 
 
 
285 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  44.87 
 
 
260 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  41.85 
 
 
246 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
288 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
288 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
288 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
250 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
254 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.36 
 
 
272 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  41.38 
 
 
267 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  42.98 
 
 
262 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  42.98 
 
 
262 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  38.46 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  39.92 
 
 
265 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
245 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.75 
 
 
251 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.15 
 
 
271 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  39.02 
 
 
272 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  38.06 
 
 
265 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  38.06 
 
 
265 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  41.05 
 
 
272 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  38.66 
 
 
265 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  38.06 
 
 
265 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  38.06 
 
 
265 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  38.62 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.76 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.57 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  38.62 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  38.72 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.1 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  40.89 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  42.17 
 
 
270 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  40.34 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  42.74 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  44.13 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  39.58 
 
 
262 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  34.47 
 
 
258 aa  181  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  33.87 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  41.99 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.79 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  37.02 
 
 
286 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  41.3 
 
 
282 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  36.73 
 
 
263 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  44.81 
 
 
272 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.03 
 
 
252 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  42.73 
 
 
264 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.69 
 
 
271 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
271 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  47.03 
 
 
252 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.79 
 
 
259 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  38.84 
 
 
274 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.2 
 
 
259 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  40.09 
 
 
287 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  42.55 
 
 
271 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.74 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  40.61 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  42.15 
 
 
285 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  38.56 
 
 
289 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  43.72 
 
 
281 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  42.53 
 
 
269 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  41.33 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40.34 
 
 
293 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  42.22 
 
 
285 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  40.95 
 
 
293 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.34 
 
 
283 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.18 
 
 
254 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.07 
 
 
254 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.6 
 
 
254 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  39.09 
 
 
260 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  38.17 
 
 
272 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  43.54 
 
 
267 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  41.82 
 
 
244 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  38.67 
 
 
272 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  38.67 
 
 
272 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>