More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0393 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.51 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  44.09 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  39.18 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 245 aa  199  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  44.6 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  43.98 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  43.75 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 249 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 		 249 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  41.36 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  43.72 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  42.2 
 
 		 263 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  43.92 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  49.49 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  42.67 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  40.69 
 
 		 254 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  36.54 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  36.54 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  43.46 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  38.56 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  36.47 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  44.97 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  39.25 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  42.13 
 
 		 254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.06 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  35.9 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  42.58 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  38.91 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  38.89 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  39.2 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  38.91 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  37.69 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  38.2 
 
 		 275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  40.19 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.93 
 
 		 252 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  37.66 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.91 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  39.06 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  38.94 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  41.67 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  41.62 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  40.09 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.94 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  42.45 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  38.52 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  40.21 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.29 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  37.09 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  38.18 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  37.55 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  40 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.92 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 265 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  38.71 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  40.4 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  37.85 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  37.67 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>