More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1443 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  50.41 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  45.68 
 
 
254 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.4 
 
 
255 aa  209  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  43.21 
 
 
254 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0393  ABC transporter related  44.6 
 
 
281 aa  192  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
250 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  38.43 
 
 
260 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  45.41 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  42.45 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 
254 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 
254 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
254 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
254 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  41.01 
 
 
270 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  42.27 
 
 
254 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
249 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  39.34 
 
 
249 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  39.45 
 
 
270 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
249 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  36.9 
 
 
275 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  42.92 
 
 
285 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
244 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  39 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
249 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
262 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  42.93 
 
 
262 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
249 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  44.5 
 
 
262 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  42.5 
 
 
260 aa  168  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
249 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
249 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
249 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
249 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
249 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  41.1 
 
 
257 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
249 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  40.19 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
249 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  37.78 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  38.57 
 
 
271 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
259 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
250 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  38.05 
 
 
252 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  38.05 
 
 
252 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  38.05 
 
 
252 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
336 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  36.49 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  40.55 
 
 
269 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
297 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  39.15 
 
 
261 aa  154  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1305  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  37.76 
 
 
277 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.19201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  35.48 
 
 
298 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  35.4 
 
 
286 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  34.48 
 
 
286 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  39.11 
 
 
269 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  33.61 
 
 
255 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  38.73 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  34.56 
 
 
262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  38.73 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  38.12 
 
 
248 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  38.53 
 
 
281 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  42.36 
 
 
251 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  35.5 
 
 
244 aa  151  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  37.04 
 
 
359 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  37.21 
 
 
245 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
255 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  36.14 
 
 
260 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  39.73 
 
 
223 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  37.66 
 
 
270 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  36.55 
 
 
272 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  34.62 
 
 
244 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  38.07 
 
 
281 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2781  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase/permease fusion protein, putative  37.18 
 
 
698 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.07 
 
 
272 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
355 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  37.23 
 
 
270 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>