More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2573 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  71.76 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  68.75 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  62.7 
 
 		 248 aa  347  9e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  55.82 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  58.4 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  56.57 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  48.39 
 
 		 257 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  46.77 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  51.09 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 263 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 254 aa  248  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  43.78 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  45.38 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  44.13 
 
 		 285 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  44.75 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  42.74 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.62 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 265 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.74 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  42.74 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 265 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.95 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.98 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.55 
 
 		 254 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.55 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  40.16 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  40.51 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  40.16 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  37.5 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  43.04 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  44.92 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  39.75 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  39.68 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.18 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  41.86 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  39.52 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  38.71 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  41.74 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  39.11 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  40.24 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  37.08 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  41.3 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.53 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  42.86 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  42.86 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  41.86 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  40.96 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  41.74 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  38 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 270 aa  191  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  43.27 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  40.62 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.12 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  41.18 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  39.76 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  40.76 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.13 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  37.8 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  37.8 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  40.78 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.59 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  39.3 
 
 		 288 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>