More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0803 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0803  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.32112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  60.33 
 
 
248 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  56.22 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  58.4 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  56.45 
 
 
256 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  54.62 
 
 
257 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  50.41 
 
 
251 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
254 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
254 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  44.71 
 
 
263 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
254 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
254 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
254 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  43.15 
 
 
257 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  43.95 
 
 
254 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
254 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.68 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  45.2 
 
 
262 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 
229 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.15 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  46.52 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.21 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.04 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.02 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  37.45 
 
 
267 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  43.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  40.16 
 
 
273 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
261 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
288 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
288 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
288 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
250 aa  191  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
261 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
260 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
265 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  41.88 
 
 
265 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.4 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  44.12 
 
 
265 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
264 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  44.12 
 
 
265 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.23 
 
 
297 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  44.12 
 
 
265 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  38.59 
 
 
275 aa  188  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  44.12 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  44.12 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
265 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  37.5 
 
 
276 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
278 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.43 
 
 
254 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  40.69 
 
 
265 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  41.88 
 
 
264 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
267 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.92 
 
 
272 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.88 
 
 
264 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  41.3 
 
 
271 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  41.88 
 
 
269 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  45.77 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  41.85 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  40.8 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.78 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  37.3 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  39.15 
 
 
282 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  41.48 
 
 
262 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  41.3 
 
 
298 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  37.1 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 
270 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  38.18 
 
 
272 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  40.17 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
272 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  37.5 
 
 
293 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  39.83 
 
 
278 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  35.8 
 
 
280 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  42.08 
 
 
278 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  38.55 
 
 
284 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  37.5 
 
 
293 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
281 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.17 
 
 
270 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  43.4 
 
 
252 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  43.4 
 
 
252 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
267 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  43.4 
 
 
252 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.67 
 
 
262 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  38.91 
 
 
283 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  41.92 
 
 
295 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  37.34 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>