More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2600 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  97.32 
 
 		 297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  94.64 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  67.57 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  50.78 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  50.39 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  49.22 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  48.46 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  45.02 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  49.22 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.84 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  45.06 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.52 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.83 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  45.54 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.67 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  41.23 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  42.5 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  43.85 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.62 
 
 		 265 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  41.76 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  44.1 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  44.3 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  39.53 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.04 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  38.61 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  41.91 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  41.49 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.26 
 
 		 258 aa  189  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  40.15 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  38.72 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.38 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  40.8 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  37.74 
 
 		 258 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.41 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 250 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.04 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.46 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  40.73 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.6 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.6 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.44 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 267 aa  185  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.45 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  40.24 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  47.45 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  43.5 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  39 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  40.65 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  43.61 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  39.91 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.75 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.7 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.73 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  42.49 
 
 		 270 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  38.93 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.86 
 
 		 280 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.35 
 
 		 244 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  39.08 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.08 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  40.89 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  43.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  40.32 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  38.85 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  37.98 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  39.92 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.45 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  37.21 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.19 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.09 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  40.08 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  43.1 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  39.34 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  40.94 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.54 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  38.76 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  39.43 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.77 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  40.94 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  36.96 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  37.28 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.36 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.49 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.86 
 
 		 256 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  40.18 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  37.28 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>