More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1667 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  54.51 
 
 
270 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  53.63 
 
 
270 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
250 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  55.2 
 
 
267 aa  254  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  54.4 
 
 
254 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  52.23 
 
 
255 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  53.41 
 
 
255 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  59.15 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  45.71 
 
 
275 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
244 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  45.65 
 
 
249 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 
249 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
249 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
249 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
249 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 
249 aa  221  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
249 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
249 aa  214  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  44.36 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.15 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  41.63 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  47.19 
 
 
271 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.75 
 
 
286 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.76 
 
 
304 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  48.48 
 
 
257 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  45.53 
 
 
266 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  40.42 
 
 
246 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 
284 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  41.77 
 
 
291 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  47.49 
 
 
262 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.86 
 
 
304 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.26 
 
 
265 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.2 
 
 
258 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
261 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.33 
 
 
286 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.15 
 
 
263 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  54.17 
 
 
223 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.59 
 
 
262 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
281 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  47 
 
 
262 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  43.1 
 
 
259 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.63 
 
 
265 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
261 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.55 
 
 
304 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 
250 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  43.72 
 
 
275 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.92 
 
 
244 aa  202  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  42.34 
 
 
267 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  44.74 
 
 
261 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.77 
 
 
259 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  39.68 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.27 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
308 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.35 
 
 
255 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  43.86 
 
 
432 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  41.46 
 
 
254 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.15 
 
 
307 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
272 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.44 
 
 
254 aa  201  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  45.76 
 
 
271 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  46.29 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.85 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  40.6 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  43.67 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  44.73 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  43.78 
 
 
288 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.29 
 
 
284 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.58 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  38.87 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.93 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.11 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.27 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  45.08 
 
 
262 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.34 
 
 
257 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.91 
 
 
283 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.38 
 
 
260 aa  198  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.15 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  42.39 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  44.74 
 
 
263 aa  198  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.51 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.62 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.51 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  39.92 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.67 
 
 
276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>