More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0671 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  87.95 
 
 
255 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  82.33 
 
 
254 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  50.41 
 
 
275 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  52.23 
 
 
260 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  50 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  61.93 
 
 
223 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  49.19 
 
 
270 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
249 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
249 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  47.98 
 
 
270 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
250 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
249 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
244 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  44.35 
 
 
249 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  43.27 
 
 
254 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  41.94 
 
 
246 aa  208  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  48.2 
 
 
262 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.09 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  45.9 
 
 
257 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.11 
 
 
262 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.5 
 
 
304 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.06 
 
 
286 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  42.06 
 
 
291 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  40.48 
 
 
304 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  43.09 
 
 
262 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  41.9 
 
 
303 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  41.9 
 
 
303 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  42.06 
 
 
303 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  41.6 
 
 
262 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
249 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  41.67 
 
 
251 aa  191  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  39.76 
 
 
260 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
249 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
249 aa  191  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 
249 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
249 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  40.39 
 
 
263 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  40.65 
 
 
267 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  44.3 
 
 
249 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.21 
 
 
253 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.08 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  40.95 
 
 
235 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  40.95 
 
 
235 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.81 
 
 
252 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.81 
 
 
252 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  40.41 
 
 
307 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  41.13 
 
 
260 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.47 
 
 
261 aa  188  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 
249 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
249 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.81 
 
 
252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.83 
 
 
283 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
249 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 
259 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.39 
 
 
286 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40 
 
 
306 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
254 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.76 
 
 
283 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
249 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  39.68 
 
 
292 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  45.15 
 
 
259 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  46.93 
 
 
285 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40.47 
 
 
265 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
254 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
254 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.36 
 
 
253 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
254 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
254 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.4 
 
 
244 aa  185  6e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.91 
 
 
260 aa  185  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  39.47 
 
 
254 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  45.41 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.72 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  38.31 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  37.9 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  37.7 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.04 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  37.94 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 
254 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  43.87 
 
 
272 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 
254 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  38.65 
 
 
267 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>