More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0452 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  43.03 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  41.39 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  41.95 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  43.15 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  40.95 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 249 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.44 
 
 		 284 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 249 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  42.79 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0450  ABC transporter related  37.65 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  37.07 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  38.46 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  38.03 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  38.03 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  36.33 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  38.21 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  39.66 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 		 249 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  39.37 
 
 		 263 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  39.48 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  37.61 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  39.82 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  35.95 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  36.55 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  36.78 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  36.4 
 
 		 271 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  37.65 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  36.33 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  36.33 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  36.59 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  40.54 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  36.93 
 
 		 284 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.56 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  39.08 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  38.2 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.34 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  38.89 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0744  ABC transporter related  39.48 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  36.84 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  35.94 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  39.13 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  38.62 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  38.16 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 288 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 288 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  38.4 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  37.34 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 281 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4557  ABC transporter related  37.77 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.218362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  39.64 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 288 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  36.24 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  36.24 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>