More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3203 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  563  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  50.41 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  51.21 
 
 
267 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  50.2 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  51 
 
 
254 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
249 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 
249 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  46.56 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  45.71 
 
 
260 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
262 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
250 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  45.97 
 
 
246 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  48.25 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  52.05 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48 
 
 
286 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.33 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  46.49 
 
 
260 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  44.62 
 
 
270 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.3 
 
 
291 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
244 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  44.62 
 
 
270 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 
249 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.98 
 
 
282 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
254 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.8 
 
 
285 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  42.57 
 
 
271 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.6 
 
 
255 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.15 
 
 
252 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.41 
 
 
271 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
259 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
261 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  43.29 
 
 
288 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
267 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  41.37 
 
 
267 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.54 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 
264 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  41.57 
 
 
253 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 
253 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.8 
 
 
254 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.06 
 
 
263 aa  198  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 
259 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
249 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.68 
 
 
260 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 
249 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  40.48 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  41.87 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.62 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  41 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.22 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.67 
 
 
244 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.92 
 
 
254 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.39 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.83 
 
 
263 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
251 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  41.15 
 
 
267 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.48 
 
 
254 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.87 
 
 
261 aa  195  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  43.18 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
257 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  46.19 
 
 
252 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  46.19 
 
 
252 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
249 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.44 
 
 
274 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  46.76 
 
 
292 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.67 
 
 
276 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.39 
 
 
304 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.1 
 
 
259 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.1 
 
 
253 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  46.19 
 
 
252 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 
284 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
249 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  48.53 
 
 
263 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.81 
 
 
283 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  41.56 
 
 
269 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.85 
 
 
251 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  38.43 
 
 
267 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  48.1 
 
 
262 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  42.73 
 
 
272 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.56 
 
 
256 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  41.98 
 
 
257 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.7 
 
 
251 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
251 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 
259 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.8 
 
 
304 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.33 
 
 
262 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>