More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  60 
 
 		 285 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  58.27 
 
 		 279 aa  314  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  56.37 
 
 		 272 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  54.79 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  55.17 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.56 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.72 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  55.12 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  54.72 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  54.33 
 
 		 265 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  54.33 
 
 		 265 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  53.94 
 
 		 265 aa  294  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  54.72 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  54.33 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  54.33 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.72 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  55.12 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  52.43 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  54.83 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  52.06 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  53.96 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  52.08 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  52.43 
 
 		 270 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.45 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  53.85 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  53.85 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  52.06 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  52.43 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  52.85 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  50.38 
 
 		 275 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  49.24 
 
 		 281 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  49.24 
 
 		 281 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  49.24 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  51.53 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  52.42 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  51.15 
 
 		 292 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  49.81 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  48.11 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  50.96 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  48.11 
 
 		 272 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.57 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  46.57 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  49.04 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.62 
 
 		 288 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  49.19 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.11 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.02 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.86 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.02 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.24 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.08 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  45.53 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.7 
 
 		 301 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.14 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  51.26 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.02 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.75 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.92 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.75 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.98 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.35 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.39 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.1 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.68 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.71 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.03 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.03 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.03 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.78 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.57 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.29 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.16 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  46.19 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2217  ABC transporter related  42.29 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.294499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.67 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.16 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.16 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.16 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.04 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.92 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.34 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.85 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>