More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1733 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  70.75 
 
 		 264 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.58 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.44 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  51.37 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.58 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.58 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.43 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  49.02 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 		 256 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.75 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.19 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.5 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.75 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.79 
 
 		 252 aa  255  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.56 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.75 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.34 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.37 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.93 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.95 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.69 
 
 		 259 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.31 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.4 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  52.16 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.46 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.54 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.81 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.34 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.6 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.08 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.91 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.18 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.18 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.28 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.53 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.39 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.21 
 
 		 263 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  48.36 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.41 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.75 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  47.43 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.28 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.44 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  46.67 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.56 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.12 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  46.67 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  46.67 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.15 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.76 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.53 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.19 
 
 		 307 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  46.18 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.12 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.99 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.43 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.11 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.11 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 269 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  50.41 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  44.8 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  47.76 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.49 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  49.38 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.67 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.93 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 281 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.83 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.55 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  46.72 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.89 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  49.39 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.22 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.93 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  46.82 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>