More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1296 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  60.82 
 
 
262 aa  295  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  49.03 
 
 
279 aa  265  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  51.02 
 
 
273 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0997  ABC transporter-related protein  50 
 
 
278 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.929403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.08 
 
 
311 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.31 
 
 
311 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  46.34 
 
 
254 aa  236  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.06 
 
 
246 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.44 
 
 
254 aa  235  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49 
 
 
284 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.43 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.22 
 
 
262 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  46.33 
 
 
313 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  47.31 
 
 
311 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.41 
 
 
264 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
272 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
264 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
263 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
256 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.38 
 
 
260 aa  228  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.89 
 
 
258 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  47.11 
 
 
273 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  48.32 
 
 
269 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
256 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.95 
 
 
297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
434 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 
438 aa  225  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.72 
 
 
263 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
278 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  48.89 
 
 
257 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50 
 
 
292 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.61 
 
 
252 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.38 
 
 
253 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.44 
 
 
267 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.47 
 
 
257 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.09 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.56 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  47.15 
 
 
445 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.46 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.12 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.02 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.81 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  46.75 
 
 
445 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 
278 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.34 
 
 
259 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.81 
 
 
254 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.44 
 
 
258 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  44.66 
 
 
297 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.28 
 
 
272 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.78 
 
 
280 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.33 
 
 
267 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  44.35 
 
 
249 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.61 
 
 
259 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
254 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.6 
 
 
260 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48 
 
 
258 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.48 
 
 
274 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
271 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.17 
 
 
272 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.11 
 
 
272 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  48.42 
 
 
258 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  46.09 
 
 
432 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
272 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
284 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
267 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
308 aa  214  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.56 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.16 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  49.34 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  49.34 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.33 
 
 
253 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  45.66 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  49.34 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  49.34 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.09 
 
 
286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.67 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.75 
 
 
663 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.3 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.83 
 
 
304 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  49.33 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.68 
 
 
271 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.33 
 
 
266 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  43.36 
 
 
437 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
265 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
446 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  47.14 
 
 
271 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>