More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1284 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  52.02 
 
 
279 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  50.8 
 
 
273 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.6 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  53.51 
 
 
253 aa  258  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.41 
 
 
254 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.21 
 
 
260 aa  245  6e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.02 
 
 
254 aa  244  8e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.79 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.81 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.44 
 
 
284 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.56 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 
254 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.01 
 
 
274 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.83 
 
 
254 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.33 
 
 
301 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.59 
 
 
258 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.74 
 
 
263 aa  236  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  53.33 
 
 
297 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  46.34 
 
 
265 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.95 
 
 
252 aa  235  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 
252 aa  234  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  46.27 
 
 
295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
311 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
311 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.82 
 
 
261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50 
 
 
272 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.96 
 
 
287 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.92 
 
 
257 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
271 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.82 
 
 
272 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.82 
 
 
272 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.46 
 
 
307 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.42 
 
 
272 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.87 
 
 
269 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
261 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.5 
 
 
267 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.57 
 
 
288 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.92 
 
 
264 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.28 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.63 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.06 
 
 
259 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
272 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
272 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  49.55 
 
 
271 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.49 
 
 
246 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.44 
 
 
259 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
278 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.35 
 
 
263 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 
259 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  46.09 
 
 
313 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.83 
 
 
257 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  45.9 
 
 
311 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.63 
 
 
256 aa  221  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
261 aa  221  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.08 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.08 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.23 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.66 
 
 
304 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
258 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.21 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.24 
 
 
259 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.32 
 
 
259 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.02 
 
 
304 aa  218  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
252 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.98 
 
 
292 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  43.75 
 
 
258 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.08 
 
 
267 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.28 
 
 
263 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  45.73 
 
 
284 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.87 
 
 
253 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50 
 
 
274 aa  216  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.39 
 
 
255 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.43 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.7 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  48.72 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.7 
 
 
286 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44 
 
 
260 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
265 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  44.67 
 
 
267 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  43.48 
 
 
259 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  44.21 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  41.86 
 
 
273 aa  214  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.01 
 
 
289 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.82 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.7 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0997  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.929403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  42.15 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.9 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.88 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.86 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.16 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>