More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0734 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  71.65 
 
 
259 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  66.53 
 
 
258 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  61.18 
 
 
257 aa  321  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
256 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.48 
 
 
254 aa  264  8e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
253 aa  261  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.8 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.81 
 
 
258 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.27 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.43 
 
 
254 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
264 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 
271 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  52.21 
 
 
263 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.39 
 
 
271 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.57 
 
 
254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50 
 
 
273 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 
271 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.8 
 
 
253 aa  255  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  53.57 
 
 
267 aa  255  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  50.66 
 
 
279 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  51.01 
 
 
287 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.61 
 
 
259 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.6 
 
 
253 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
252 aa  249  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.2 
 
 
272 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.37 
 
 
272 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 
261 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.59 
 
 
260 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
272 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.44 
 
 
259 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  51.91 
 
 
286 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.58 
 
 
259 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
272 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.96 
 
 
264 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.39 
 
 
264 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
278 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.27 
 
 
297 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.82 
 
 
264 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  51.59 
 
 
267 aa  247  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.97 
 
 
252 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.83 
 
 
259 aa  245  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.5 
 
 
255 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48 
 
 
263 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.28 
 
 
286 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.22 
 
 
259 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.99 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  52.17 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.18 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.83 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.99 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.91 
 
 
280 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.8 
 
 
267 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.22 
 
 
264 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.8 
 
 
267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.18 
 
 
274 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.02 
 
 
261 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.18 
 
 
289 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
273 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  51.54 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.64 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.27 
 
 
256 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
261 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.5 
 
 
258 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.16 
 
 
272 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.4 
 
 
267 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  52.86 
 
 
311 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.74 
 
 
263 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.19 
 
 
283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.5 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.42 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  51.08 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.44 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.8 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  46.06 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.41 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.23 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.83 
 
 
291 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  47.74 
 
 
245 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  53.15 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.67 
 
 
262 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  48.57 
 
 
259 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.25 
 
 
258 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.78 
 
 
288 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.79 
 
 
283 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
259 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  48.16 
 
 
259 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.6 
 
 
306 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.92 
 
 
304 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  53.3 
 
 
311 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.8 
 
 
284 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.67 
 
 
274 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
308 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  47.83 
 
 
288 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>