More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4509 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  91.01 
 
 		 267 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  67.31 
 
 		 272 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  67.69 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  67.69 
 
 		 272 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  71.65 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  70.88 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  70.3 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  66.79 
 
 		 263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  66.28 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  65.9 
 
 		 271 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  67.05 
 
 		 271 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  66.16 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  65.77 
 
 		 272 aa  343  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  53.25 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  54.08 
 
 		 272 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  52.48 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.5 
 
 		 252 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.37 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.49 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.2 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.19 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.4 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  51.52 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.41 
 
 		 258 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.35 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  49.78 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  51.08 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.52 
 
 		 297 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  51.52 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.22 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  55.56 
 
 		 263 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.37 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  53.42 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.19 
 
 		 283 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.72 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.41 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  48.29 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.02 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  48.09 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  50.6 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.26 
 
 		 288 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.64 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  48.29 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.97 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  48.4 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.63 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.41 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 308 aa  237  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.79 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.77 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.3 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 261 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.51 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  49.4 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.63 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  53.22 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.59 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.59 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.79 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  51.19 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  52.48 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.2 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.2 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.4 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.4 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  46.88 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.58 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.77 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  45.88 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.21 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.21 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  53.52 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.32 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.82 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.93 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.3 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>